نمایندگان پس از بحث و بررسی بند 2 ماده واحده این قانون تسریع را با افزودن عبارت «از محل سرمایهگذاری بخش غیردولتی» اصلاح کردند.
براساس این اصلاحیه، سازمان بنادر و دریانوردی موظف است جهت کاهش انتظار نوبت کشتیهای تجاری نسبت به توسعه و تکمیل بنادر و تاسیسات بندری و تامین تجهیزات موردنیاز دریایی و بندری کشور در چارچوب قوانین و مقررات حاکم بر مناطق ویژه اقتصادی و آزاد تجاری ـ صنعتی از محل منابع داخلی خود مندرج در بودجه سنواتی و سرمایهگذاری بخش غیردولتی اقدام کند.